Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFU8

Tp53inp2, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53inp2Q8CFU8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tp53inp2Q8CFU8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms