Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hpf1Q8CFE2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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