Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ercc8Q8CFD5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ercc8Q8CFD5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ercc8Q8CFD5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ercc8Q8CFD5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ercc8Q8CFD5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ercc8Q8CFD5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ercc8Q8CFD5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ercc8Q8CFD5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ercc8Q8CFD5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ercc8Q8CFD5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ercc8Q8CFD5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ercc8Q8CFD5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ercc8Q8CFD5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Ercc8Q8CFD5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
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