Protein–RNA interactions for Protein: Q8C735

Lin9, Protein lin-9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin9Q8C735 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lin9Q8C735 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms