Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5X9

Gm5142, Predicted gene 5142, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5142Q8C5X9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5142Q8C5X9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms