Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

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Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Ccdc187Q8C5V8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Ccdc187Q8C5V8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Ccdc187Q8C5V8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ccdc187Q8C5V8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ccdc187Q8C5V8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc187Q8C5V8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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