Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Ccdc113Q8C5T8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc113Q8C5T8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc113Q8C5T8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Ccdc113Q8C5T8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Ccdc113Q8C5T8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc113Q8C5T8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc113Q8C5T8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Ccdc113Q8C5T8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc113Q8C5T8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Ccdc113Q8C5T8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Ccdc113Q8C5T8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc113Q8C5T8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Ccdc113Q8C5T8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Ccdc113Q8C5T8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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