Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ska3Q8C263 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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