Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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FarsaQ8C0C7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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FarsaQ8C0C7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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FarsaQ8C0C7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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FarsaQ8C0C7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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FarsaQ8C0C7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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FarsaQ8C0C7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FarsaQ8C0C7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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