Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms