Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp38Q8BW70 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Usp38Q8BW70 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Usp38Q8BW70 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Usp38Q8BW70 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Usp38Q8BW70 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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