Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Zfp398Q8BV16 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Zfp398Q8BV16 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Zfp398Q8BV16 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Zfp398Q8BV16 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Zfp398Q8BV16 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Zfp398Q8BV16 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Zfp398Q8BV16 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Zfp398Q8BV16 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Zfp398Q8BV16 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Zfp398Q8BV16 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zfp398Q8BV16 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Zfp398Q8BV16 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp398Q8BV16 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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