Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pggt1bQ8BUY9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms