Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSS9

Ppfia2, Liprin-alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia2Q8BSS9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia2Q8BSS9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms