Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gtf3c4Q8BMQ2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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