Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Grik4Q8BMF5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grik4Q8BMF5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms