Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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