Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rufy1Q8BIJ7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rufy1Q8BIJ7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms