Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Htatsf1Q8BGC0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Htatsf1Q8BGC0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms