Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc50Q810U5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc50Q810U5 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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