Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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