Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW5

Whrn, Whirlin, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhrnQ80VW5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhrnQ80VW5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms