Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms