Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifna12Q80SS5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms