Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lamp3Q7TST5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms