Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ckap2lQ7TS74 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ckap2lQ7TS74 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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