Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actn1Q7TPR4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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