Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno2Q7TNB8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms