Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smap2Q7TN29 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms