Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Shq1Q7TMX5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Shq1Q7TMX5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Shq1Q7TMX5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Shq1Q7TMX5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Shq1Q7TMX5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Shq1Q7TMX5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shq1Q7TMX5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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