Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms