Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rph3alQ768S4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rph3alQ768S4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rph3alQ768S4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rph3alQ768S4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rph3alQ768S4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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