Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nme8Q715T0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme8Q715T0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms