Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SpopQ6ZWS8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SpopQ6ZWS8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms