Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Slc44a1Q6X893 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc44a1Q6X893 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms