Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms