Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rad54bQ6PFE3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rad54bQ6PFE3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rad54bQ6PFE3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rad54bQ6PFE3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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