Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Taf1cQ6PDZ2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Taf1cQ6PDZ2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Taf1cQ6PDZ2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Taf1cQ6PDZ2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Taf1cQ6PDZ2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Taf1cQ6PDZ2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Taf1cQ6PDZ2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Taf1cQ6PDZ2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Taf1cQ6PDZ2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf1cQ6PDZ2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf1cQ6PDZ2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf1cQ6PDZ2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf1cQ6PDZ2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf1cQ6PDZ2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf1cQ6PDZ2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf1cQ6PDZ2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf1cQ6PDZ2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf1cQ6PDZ2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf1cQ6PDZ2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf1cQ6PDZ2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf1cQ6PDZ2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Taf1cQ6PDZ2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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