Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc85bQ6PDY0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms