Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac10Q6P3E7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac10Q6P3E7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms