Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Asic1Q6NXK8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms