Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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NipblQ6KCD5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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NipblQ6KCD5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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NipblQ6KCD5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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NipblQ6KCD5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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NipblQ6KCD5 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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NipblQ6KCD5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms