Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mvb12bQ6KAU4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms