Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVL5

Lcn12, Epididymal-specific lipocalin-12, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn12Q6JVL5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Lcn12Q6JVL5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Lcn12Q6JVL5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Lcn12Q6JVL5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Lcn12Q6JVL5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Lcn12Q6JVL5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Lcn12Q6JVL5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Lcn12Q6JVL5 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lcn12Q6JVL5 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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