Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Krt39Q6IFX4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms