Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nop58Q6DFW4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop58Q6DFW4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms