Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6DFW0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6DFW0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6DFW0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q6DFW0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6DFW0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6DFW0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6DFW0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6DFW0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6DFW0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6DFW0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6DFW0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6DFW0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6DFW0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6DFW0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6DFW0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6DFW0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6DFW0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6DFW0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6DFW0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6DFW0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6DFW0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6DFW0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6DFW0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6DFW0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6DFW0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6DFW0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6DFW0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Q6DFW0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q6DFW0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6DFW0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6DFW0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6DFW0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6DFW0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6DFW0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6DFW0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6DFW0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6DFW0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6DFW0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6DFW0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6DFW0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6DFW0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6DFW0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6DFW0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q6DFW0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6DFW0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
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Q6DFW0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6DFW0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q6DFW0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6DFW0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6DFW0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6DFW0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q6DFW0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6DFW0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6DFW0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6DFW0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6DFW0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6DFW0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6DFW0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6DFW0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6DFW0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6DFW0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6DFW0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6DFW0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6DFW0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6DFW0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6DFW0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6DFW0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6DFW0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6DFW0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6DFW0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
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