Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Pdzrn3Q69ZS0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Pdzrn3Q69ZS0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Pdzrn3Q69ZS0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Pdzrn3Q69ZS0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Pdzrn3Q69ZS0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Pdzrn3Q69ZS0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Pdzrn3Q69ZS0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Pdzrn3Q69ZS0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Pdzrn3Q69ZS0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Pdzrn3Q69ZS0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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