Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Sh3rf1Q69ZI1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Sh3rf1Q69ZI1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Sh3rf1Q69ZI1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Sh3rf1Q69ZI1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3rf1Q69ZI1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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