Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

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Length 577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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Msl2Q69ZF8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Msl2Q69ZF8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Msl2Q69ZF8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Msl2Q69ZF8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Msl2Q69ZF8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Msl2Q69ZF8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Msl2Q69ZF8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Msl2Q69ZF8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Msl2Q69ZF8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms